Суперечливе заняття трону після правління Крезимира IV (1058-1074) та Звонимира (1075-1089) призвело до угорського вторгнення. За угорського короля два королівства об'єдналися у 1102 році.
    З того часу й до 1918 року королі Угорщини були також королями Хорватії, губернаторами, що представлялися, але в той же час Хорватія мала власний парламент (Сабор) й значну автономію.
    Після 1420 року місто-держава Венеція керувала всією областю Далмації. В 1526 році короля Угорщини Луї II було вбито, а його армія була розбита османськими військами, що стало причиною правління османами Угорщиною та Хорватією протягом 150 років.

У 1699 році австрійські Габсбурги, які успадковували корону Короля Луї в 1526 році, звільнивши Угорщину та Хорватію від османів.
    Хорватія залишалася розділеною. Далмація та Істрія були під управлінням Венеції до французького імператора Наполеона, який скасував Венеціанську республіку у 1797 році.
    Коли Далмація та Істрія приєдналися до імперії Габсбургів у 1815 році, вони стали австрійськими, а не угорськими областями, й залишалися відокремленим від решти частин Хорватії.
    Хорватія та Славонія були формально частиною Угорщини, хоча велика частина їх території залишалася під прямим австрійським правлінням до кінця 19-го століття. Багато православних сербів та влахів (румунів) оселилися на цій землі.

Хорватська армія допомогла австрійцям придушувати угорську революцію 1848 року. Хорватські лідери сподівалися, що Габсбурги винагородять їх за допомогу, відділивши об'єднану Хорватію від Угорщини.
Проте, австро-угорська угода від 1867 року, яка і створила союз Австрії та Угорщини, знову приєднала Хорватію і Славонію до Угорщини, а Далмацію - до Австрії.